1、貫徹黨和國家的衛生工作方針、政策、法律、法規，協助制訂有關法規的實施細則和規范性文件，制訂全區衛生事業發展規劃并組織實施；研究指導全區醫療衛生改革；依法行政，實施對全區醫療衛生的全行業管理。

2、會同有關部門制定全區區域衛生規劃，統籌規劃與協調全區衛生資源配置；指導和督促各衛生單位貫徹實施區域衛生規劃；制訂全區農村衛生，城市社區衛生服務和健康教育規劃，落實初級衛生保健目標。

3、制訂并監督實施全區傳染病、慢性非傳染性疾病及其它嚴重危害人體健康疾病的防治規劃和防治方案，負責重大疫情的處理；對全區食品、環境、職業、放射、公共場所、化妝品、飲用水及學校衛生監督和勞動能力及傷殘醫學鑒定。

4、負責全區醫療行政管理，負責實施醫療機構、醫務人員的準入制度；組織實施國家醫療質量標準、技術標準、服務規范和衛生人員職業道德規范。依法監督管理全區獻血及輸血工作；負責組織全區衛生技術力量完成突發事件和自然災害的傷病救護任務。

5、貫徹執行中西醫并重的方針，制訂并實施全區中醫、中西醫結合事業的發展規劃。

6、制訂全區重點醫學科技發展規劃并組織實施；組織全區重點醫藥衛生科研攻關和科技成果鑒定、推廣及應用工作；制訂人區衛生人才培養和全區醫學繼續教育的規劃并指導實施；指導和管理全區衛生專業技術隊伍建設，配合有關部門做好全區衛生專業技術職務的考試和評審工作。

7、依法制訂區婦幼衛生工作規劃和政策并組織實施；負責管理全區婦女兒童衛生保健和婚前保健工作，協調有關部門做好優生優育、提高出生人口素質的工作；會同有關部門做好計劃生育技術指導工作。

8、會同有關部門負責區級衛生事業經費的預決算、財務管理、審計監督及全區衛生事業綜合效益評價，負責監督區屬衛生事業單位的國有資產管理；會同管理全區衛生信息統計工作；協同有關部門制訂全區醫療衛生服務價格標準并監督執行。

9、負責全區醫療衛生外事工作及對外援助和勞務輸出的管理，組織衛生技術國際交流與合作。