1950年新中國解放后，由西南軍政委員會接辦，成為西南局干部子弟學校，鄧小平同志親口指示“一切不動，只許辦好，不許辦壞”。1954年西南大區撤銷，學校交重慶教育局直管；1955年8月，巴蜀學校一分為三，中學部改為重慶市第41中學校。1958年學校成為重慶市中學界唯一的“重慶市百面紅旗”單位。1978年，學校被確定為四川省首批重點中學。1991年恢復更名為重慶市巴蜀中學校。

 

重慶巴蜀中學是重慶市教委直屬重點中學，北京大學首批校長實名推薦制中學，清華大學首批自主選拔“新百年領軍計劃”推薦資格中學，連續五屆入選中國百強中學，2011年入選美國馬里蘭大學評選的中國高中五十強（第23名），2013年入圍《中國頂級中學》名錄，全國現代教育技術實驗學校，漢語國際推廣中小學基地，全國國際象棋高水平后備人才培訓基地，國家體育傳統項目（田徑項目）示范基地，CCTV“最佳雇主”，中央人民廣播電臺“全國最具幸福感的學校”和“全國校園文化特色獎”,全國德育先進學校，全國藝術教育先進學校，全國奧林匹克教育示范學校，教育部信息化試點學校，全國少年兒童科學體驗活動優秀示范學校，全國青少年科技創新大賽優秀基層組織單位，全國中小學創新實踐活動優秀組織單位，重慶市文明單位，影響重慶教育十大品牌中學，重慶市教育科研實驗基地，重慶市民主管理示范學校。

 

八十年來，巴蜀中學人才輩出，群星璀璨。學校為國家培養了六萬多名學生，其中不乏政治家、軍事家、科學家、文學家、藝術家和企業家：全國人大副委員長陳昌智，國務院原副總理鄒家華，全國政協原副主席閻明復，人事部原副部長戴光前，國家氣象局原局長鄒競蒙，國家關工委原副主任朱琳，重慶市人大原副主任盧曉鐘，重慶市政協原副主席夏培度，四川省人大原副主任陶曦晦，昆明原市委書記賀興洲，兩院院士李朝義、吳天一、汪應洛、張煥喬、張存浩，著名經濟學家吳敬璉，原八一電影制片廠廠長王曉棠（女）將軍，著名物理學家劉寄星、馮登泰，著名醫學專家劉光耀，著名歌唱家龔七妹、吳國松、匡亞新，著名舞蹈家陳澤美、洪文莉，民生集團董事長盧國紀，電腦報社長陳宗周，國學名人李里，江姐烈士的兒子彭云博士，世界跳傘冠軍劉德欣，國際象棋冠軍黃茜、徐媛媛，湖南衛視著名主持人楊樂樂，中央電視臺主持人曾湉……2003年春，原中共總書記、國家主席胡錦濤的夫人劉永清校友回訪了母校；是年秋，原全國人大委員長、國務院總理李鵬及夫人朱琳校友親切接見了以傅唯泉為首的校長班子；2012年春，全國人大副委員長陳昌智校友回訪母校，他們對巴蜀中學給予了高度評價，極大鼓舞了巴蜀師生奮勇向前。